Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MBD5Q9P267 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MBD5Q9P267 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MBD5Q9P267 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MBD5Q9P267 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MBD5Q9P267 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MBD5Q9P267 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
MBD5Q9P267 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MBD5Q9P267 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MBD5Q9P267 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MBD5Q9P267 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MBD5Q9P267 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MBD5Q9P267 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MBD5Q9P267 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MBD5Q9P267 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MBD5Q9P267 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MBD5Q9P267 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MBD5Q9P267 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MBD5Q9P267 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MBD5Q9P267 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MBD5Q9P267 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MBD5Q9P267 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MBD5Q9P267 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MBD5Q9P267 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
MBD5Q9P267 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MBD5Q9P267 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MBD5Q9P267 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MBD5Q9P267 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MBD5Q9P267 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MBD5Q9P267 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MBD5Q9P267 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MBD5Q9P267 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MBD5Q9P267 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MBD5Q9P267 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MBD5Q9P267 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MBD5Q9P267 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MBD5Q9P267 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MBD5Q9P267 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
MBD5Q9P267 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
MBD5Q9P267 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
MBD5Q9P267 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
MBD5Q9P267 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
MBD5Q9P267 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
MBD5Q9P267 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.04
MBD5Q9P267 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
MBD5Q9P267 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
MBD5Q9P267 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
MBD5Q9P267 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
MBD5Q9P267 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.04
MBD5Q9P267 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
MBD5Q9P267 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MBD5Q9P267 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MBD5Q9P267 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MBD5Q9P267 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MBD5Q9P267 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MBD5Q9P267 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MBD5Q9P267 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MBD5Q9P267 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MBD5Q9P267 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MBD5Q9P267 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
MBD5Q9P267 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MBD5Q9P267 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MBD5Q9P267 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MBD5Q9P267 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MBD5Q9P267 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MBD5Q9P267 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MBD5Q9P267 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
MBD5Q9P267 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MBD5Q9P267 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
MBD5Q9P267 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MBD5Q9P267 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MBD5Q9P267 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MBD5Q9P267 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MBD5Q9P267 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MBD5Q9P267 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MBD5Q9P267 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MBD5Q9P267 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MBD5Q9P267 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MBD5Q9P267 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MBD5Q9P267 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MBD5Q9P267 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MBD5Q9P267 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MBD5Q9P267 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MBD5Q9P267 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MBD5Q9P267 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
MBD5Q9P267 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MBD5Q9P267 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MBD5Q9P267 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MBD5Q9P267 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MBD5Q9P267 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MBD5Q9P267 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MBD5Q9P267 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
MBD5Q9P267 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MBD5Q9P267 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
MBD5Q9P267 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MBD5Q9P267 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MBD5Q9P267 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MBD5Q9P267 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MBD5Q9P267 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MBD5Q9P267 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms