Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms