Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG2

ZDHHC3, Palmitoyltransferase ZDHHC3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC3Q9NYG2 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms