Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VNN3Q9NY84 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VNN3Q9NY84 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VNN3Q9NY84 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VNN3Q9NY84 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VNN3Q9NY84 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VNN3Q9NY84 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VNN3Q9NY84 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VNN3Q9NY84 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VNN3Q9NY84 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VNN3Q9NY84 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VNN3Q9NY84 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VNN3Q9NY84 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
VNN3Q9NY84 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VNN3Q9NY84 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VNN3Q9NY84 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VNN3Q9NY84 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VNN3Q9NY84 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VNN3Q9NY84 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VNN3Q9NY84 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VNN3Q9NY84 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VNN3Q9NY84 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VNN3Q9NY84 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VNN3Q9NY84 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VNN3Q9NY84 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VNN3Q9NY84 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VNN3Q9NY84 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VNN3Q9NY84 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
VNN3Q9NY84 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VNN3Q9NY84 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VNN3Q9NY84 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VNN3Q9NY84 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VNN3Q9NY84 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VNN3Q9NY84 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VNN3Q9NY84 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VNN3Q9NY84 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VNN3Q9NY84 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VNN3Q9NY84 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VNN3Q9NY84 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VNN3Q9NY84 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VNN3Q9NY84 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VNN3Q9NY84 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VNN3Q9NY84 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VNN3Q9NY84 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VNN3Q9NY84 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VNN3Q9NY84 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VNN3Q9NY84 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VNN3Q9NY84 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
VNN3Q9NY84 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VNN3Q9NY84 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VNN3Q9NY84 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
VNN3Q9NY84 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VNN3Q9NY84 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VNN3Q9NY84 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VNN3Q9NY84 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VNN3Q9NY84 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VNN3Q9NY84 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VNN3Q9NY84 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VNN3Q9NY84 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VNN3Q9NY84 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VNN3Q9NY84 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VNN3Q9NY84 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms