Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms