Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms