Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LTBP3Q9NS15 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LTBP3Q9NS15 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LTBP3Q9NS15 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LTBP3Q9NS15 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LTBP3Q9NS15 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LTBP3Q9NS15 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LTBP3Q9NS15 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LTBP3Q9NS15 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LTBP3Q9NS15 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LTBP3Q9NS15 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LTBP3Q9NS15 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LTBP3Q9NS15 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LTBP3Q9NS15 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LTBP3Q9NS15 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LTBP3Q9NS15 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LTBP3Q9NS15 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LTBP3Q9NS15 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LTBP3Q9NS15 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LTBP3Q9NS15 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LTBP3Q9NS15 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LTBP3Q9NS15 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LTBP3Q9NS15 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LTBP3Q9NS15 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LTBP3Q9NS15 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LTBP3Q9NS15 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LTBP3Q9NS15 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LTBP3Q9NS15 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LTBP3Q9NS15 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LTBP3Q9NS15 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LTBP3Q9NS15 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LTBP3Q9NS15 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LTBP3Q9NS15 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LTBP3Q9NS15 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LTBP3Q9NS15 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LTBP3Q9NS15 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LTBP3Q9NS15 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LTBP3Q9NS15 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LTBP3Q9NS15 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LTBP3Q9NS15 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LTBP3Q9NS15 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LTBP3Q9NS15 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LTBP3Q9NS15 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LTBP3Q9NS15 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LTBP3Q9NS15 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LTBP3Q9NS15 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LTBP3Q9NS15 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LTBP3Q9NS15 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LTBP3Q9NS15 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LTBP3Q9NS15 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LTBP3Q9NS15 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LTBP3Q9NS15 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LTBP3Q9NS15 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LTBP3Q9NS15 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LTBP3Q9NS15 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LTBP3Q9NS15 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LTBP3Q9NS15 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LTBP3Q9NS15 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LTBP3Q9NS15 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LTBP3Q9NS15 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LTBP3Q9NS15 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LTBP3Q9NS15 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LTBP3Q9NS15 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LTBP3Q9NS15 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LTBP3Q9NS15 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LTBP3Q9NS15 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LTBP3Q9NS15 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LTBP3Q9NS15 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LTBP3Q9NS15 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LTBP3Q9NS15 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LTBP3Q9NS15 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LTBP3Q9NS15 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LTBP3Q9NS15 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LTBP3Q9NS15 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LTBP3Q9NS15 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LTBP3Q9NS15 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LTBP3Q9NS15 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LTBP3Q9NS15 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LTBP3Q9NS15 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LTBP3Q9NS15 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LTBP3Q9NS15 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LTBP3Q9NS15 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LTBP3Q9NS15 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LTBP3Q9NS15 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LTBP3Q9NS15 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LTBP3Q9NS15 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LTBP3Q9NS15 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LTBP3Q9NS15 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LTBP3Q9NS15 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LTBP3Q9NS15 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LTBP3Q9NS15 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LTBP3Q9NS15 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LTBP3Q9NS15 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LTBP3Q9NS15 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LTBP3Q9NS15 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LTBP3Q9NS15 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LTBP3Q9NS15 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LTBP3Q9NS15 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LTBP3Q9NS15 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LTBP3Q9NS15 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
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