Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV6

PRDM10, PR domain zinc finger protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM10Q9NQV6 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRDM10Q9NQV6 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRDM10Q9NQV6 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRDM10Q9NQV6 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRDM10Q9NQV6 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRDM10Q9NQV6 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRDM10Q9NQV6 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PRDM10Q9NQV6 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRDM10Q9NQV6 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRDM10Q9NQV6 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PRDM10Q9NQV6 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRDM10Q9NQV6 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PRDM10Q9NQV6 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PRDM10Q9NQV6 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRDM10Q9NQV6 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRDM10Q9NQV6 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRDM10Q9NQV6 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRDM10Q9NQV6 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRDM10Q9NQV6 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRDM10Q9NQV6 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRDM10Q9NQV6 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRDM10Q9NQV6 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRDM10Q9NQV6 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRDM10Q9NQV6 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRDM10Q9NQV6 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRDM10Q9NQV6 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRDM10Q9NQV6 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRDM10Q9NQV6 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRDM10Q9NQV6 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRDM10Q9NQV6 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRDM10Q9NQV6 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRDM10Q9NQV6 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRDM10Q9NQV6 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRDM10Q9NQV6 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRDM10Q9NQV6 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRDM10Q9NQV6 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRDM10Q9NQV6 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRDM10Q9NQV6 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRDM10Q9NQV6 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRDM10Q9NQV6 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRDM10Q9NQV6 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRDM10Q9NQV6 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PRDM10Q9NQV6 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRDM10Q9NQV6 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRDM10Q9NQV6 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PRDM10Q9NQV6 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRDM10Q9NQV6 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRDM10Q9NQV6 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PRDM10Q9NQV6 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRDM10Q9NQV6 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRDM10Q9NQV6 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRDM10Q9NQV6 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRDM10Q9NQV6 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRDM10Q9NQV6 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRDM10Q9NQV6 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRDM10Q9NQV6 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PRDM10Q9NQV6 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRDM10Q9NQV6 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRDM10Q9NQV6 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRDM10Q9NQV6 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRDM10Q9NQV6 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRDM10Q9NQV6 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRDM10Q9NQV6 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRDM10Q9NQV6 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRDM10Q9NQV6 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRDM10Q9NQV6 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRDM10Q9NQV6 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRDM10Q9NQV6 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRDM10Q9NQV6 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRDM10Q9NQV6 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRDM10Q9NQV6 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRDM10Q9NQV6 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRDM10Q9NQV6 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRDM10Q9NQV6 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PRDM10Q9NQV6 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRDM10Q9NQV6 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PRDM10Q9NQV6 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRDM10Q9NQV6 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRDM10Q9NQV6 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRDM10Q9NQV6 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRDM10Q9NQV6 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRDM10Q9NQV6 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRDM10Q9NQV6 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRDM10Q9NQV6 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRDM10Q9NQV6 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRDM10Q9NQV6 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRDM10Q9NQV6 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRDM10Q9NQV6 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRDM10Q9NQV6 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PRDM10Q9NQV6 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRDM10Q9NQV6 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRDM10Q9NQV6 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRDM10Q9NQV6 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRDM10Q9NQV6 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRDM10Q9NQV6 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRDM10Q9NQV6 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRDM10Q9NQV6 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRDM10Q9NQV6 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRDM10Q9NQV6 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRDM10Q9NQV6 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms