Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
CLSPNQ9HAW4 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms