Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LINC00597Q9H2U6 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LINC00597Q9H2U6 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LINC00597Q9H2U6 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
LINC00597Q9H2U6 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LINC00597Q9H2U6 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LINC00597Q9H2U6 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LINC00597Q9H2U6 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LINC00597Q9H2U6 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LINC00597Q9H2U6 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LINC00597Q9H2U6 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LINC00597Q9H2U6 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LINC00597Q9H2U6 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LINC00597Q9H2U6 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LINC00597Q9H2U6 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LINC00597Q9H2U6 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
LINC00597Q9H2U6 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
LINC00597Q9H2U6 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
LINC00597Q9H2U6 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
LINC00597Q9H2U6 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00597Q9H2U6 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00597Q9H2U6 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00597Q9H2U6 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00597Q9H2U6 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00597Q9H2U6 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00597Q9H2U6 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00597Q9H2U6 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00597Q9H2U6 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00597Q9H2U6 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00597Q9H2U6 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00597Q9H2U6 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00597Q9H2U6 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00597Q9H2U6 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00597Q9H2U6 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00597Q9H2U6 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00597Q9H2U6 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00597Q9H2U6 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00597Q9H2U6 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00597Q9H2U6 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00597Q9H2U6 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00597Q9H2U6 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00597Q9H2U6 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00597Q9H2U6 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00597Q9H2U6 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00597Q9H2U6 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00597Q9H2U6 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00597Q9H2U6 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00597Q9H2U6 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00597Q9H2U6 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00597Q9H2U6 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00597Q9H2U6 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00597Q9H2U6 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC19■□□□□ 0.63
LINC00597Q9H2U6 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC19■□□□□ 0.63
LINC00597Q9H2U6 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00597Q9H2U6 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00597Q9H2U6 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00597Q9H2U6 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00597Q9H2U6 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00597Q9H2U6 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC19■□□□□ 0.63
LINC00597Q9H2U6 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00597Q9H2U6 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00597Q9H2U6 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00597Q9H2U6 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00597Q9H2U6 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00597Q9H2U6 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00597Q9H2U6 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00597Q9H2U6 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00597Q9H2U6 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00597Q9H2U6 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00597Q9H2U6 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00597Q9H2U6 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00597Q9H2U6 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC00597Q9H2U6 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC00597Q9H2U6 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC00597Q9H2U6 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC00597Q9H2U6 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC00597Q9H2U6 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC00597Q9H2U6 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC00597Q9H2U6 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC00597Q9H2U6 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC00597Q9H2U6 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC00597Q9H2U6 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC00597Q9H2U6 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC00597Q9H2U6 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC00597Q9H2U6 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC00597Q9H2U6 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC00597Q9H2U6 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC00597Q9H2U6 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC00597Q9H2U6 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC00597Q9H2U6 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC00597Q9H2U6 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC00597Q9H2U6 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC00597Q9H2U6 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC00597Q9H2U6 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC00597Q9H2U6 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC00597Q9H2U6 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC00597Q9H2U6 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC00597Q9H2U6 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC00597Q9H2U6 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC00597Q9H2U6 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms