Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0E8

LNPK, Protein lunapark, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNPKQ9C0E8 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
LNPKQ9C0E8 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LNPKQ9C0E8 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LNPKQ9C0E8 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LNPKQ9C0E8 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LNPKQ9C0E8 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LNPKQ9C0E8 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LNPKQ9C0E8 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LNPKQ9C0E8 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LNPKQ9C0E8 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LNPKQ9C0E8 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.9 ms