Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXQ1Q9C009 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXQ1Q9C009 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXQ1Q9C009 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXQ1Q9C009 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXQ1Q9C009 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FOXQ1Q9C009 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FOXQ1Q9C009 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FOXQ1Q9C009 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FOXQ1Q9C009 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FOXQ1Q9C009 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FOXQ1Q9C009 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FOXQ1Q9C009 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
FOXQ1Q9C009 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FOXQ1Q9C009 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FOXQ1Q9C009 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FOXQ1Q9C009 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FOXQ1Q9C009 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FOXQ1Q9C009 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FOXQ1Q9C009 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FOXQ1Q9C009 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FOXQ1Q9C009 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
FOXQ1Q9C009 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FOXQ1Q9C009 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FOXQ1Q9C009 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FOXQ1Q9C009 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FOXQ1Q9C009 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FOXQ1Q9C009 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FOXQ1Q9C009 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FOXQ1Q9C009 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FOXQ1Q9C009 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FOXQ1Q9C009 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FOXQ1Q9C009 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FOXQ1Q9C009 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FOXQ1Q9C009 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FOXQ1Q9C009 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FOXQ1Q9C009 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FOXQ1Q9C009 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FOXQ1Q9C009 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FOXQ1Q9C009 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FOXQ1Q9C009 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
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FOXQ1Q9C009 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
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FOXQ1Q9C009 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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FOXQ1Q9C009 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FOXQ1Q9C009 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FOXQ1Q9C009 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
FOXQ1Q9C009 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FOXQ1Q9C009 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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FOXQ1Q9C009 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FOXQ1Q9C009 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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FOXQ1Q9C009 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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FOXQ1Q9C009 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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FOXQ1Q9C009 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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