Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRIP1Q9BX63 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRIP1Q9BX63 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
BRIP1Q9BX63 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRIP1Q9BX63 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRIP1Q9BX63 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRIP1Q9BX63 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRIP1Q9BX63 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRIP1Q9BX63 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRIP1Q9BX63 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRIP1Q9BX63 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
BRIP1Q9BX63 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
BRIP1Q9BX63 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRIP1Q9BX63 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
BRIP1Q9BX63 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
BRIP1Q9BX63 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRIP1Q9BX63 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRIP1Q9BX63 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRIP1Q9BX63 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRIP1Q9BX63 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRIP1Q9BX63 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRIP1Q9BX63 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRIP1Q9BX63 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRIP1Q9BX63 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
BRIP1Q9BX63 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
BRIP1Q9BX63 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRIP1Q9BX63 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRIP1Q9BX63 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRIP1Q9BX63 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRIP1Q9BX63 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRIP1Q9BX63 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRIP1Q9BX63 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRIP1Q9BX63 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRIP1Q9BX63 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRIP1Q9BX63 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
BRIP1Q9BX63 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRIP1Q9BX63 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRIP1Q9BX63 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRIP1Q9BX63 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRIP1Q9BX63 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRIP1Q9BX63 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRIP1Q9BX63 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRIP1Q9BX63 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
BRIP1Q9BX63 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRIP1Q9BX63 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
BRIP1Q9BX63 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
BRIP1Q9BX63 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRIP1Q9BX63 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRIP1Q9BX63 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRIP1Q9BX63 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRIP1Q9BX63 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRIP1Q9BX63 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRIP1Q9BX63 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRIP1Q9BX63 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRIP1Q9BX63 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
BRIP1Q9BX63 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms