Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms