Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms