Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PITX2Q99697 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms