Protein–RNA interactions for Protein: Q99569

PKP4, Plakophilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4Q99569 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms