Protein–RNA interactions for Protein: Q96S66

CLCC1, Chloride channel CLIC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCC1Q96S66 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLCC1Q96S66 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLCC1Q96S66 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLCC1Q96S66 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLCC1Q96S66 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLCC1Q96S66 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLCC1Q96S66 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLCC1Q96S66 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLCC1Q96S66 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLCC1Q96S66 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CLCC1Q96S66 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLCC1Q96S66 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLCC1Q96S66 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLCC1Q96S66 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLCC1Q96S66 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLCC1Q96S66 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLCC1Q96S66 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLCC1Q96S66 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CLCC1Q96S66 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLCC1Q96S66 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLCC1Q96S66 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLCC1Q96S66 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLCC1Q96S66 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLCC1Q96S66 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CLCC1Q96S66 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLCC1Q96S66 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLCC1Q96S66 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLCC1Q96S66 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLCC1Q96S66 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLCC1Q96S66 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLCC1Q96S66 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLCC1Q96S66 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLCC1Q96S66 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLCC1Q96S66 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLCC1Q96S66 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLCC1Q96S66 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLCC1Q96S66 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLCC1Q96S66 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLCC1Q96S66 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLCC1Q96S66 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLCC1Q96S66 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLCC1Q96S66 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLCC1Q96S66 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLCC1Q96S66 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLCC1Q96S66 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLCC1Q96S66 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLCC1Q96S66 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLCC1Q96S66 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLCC1Q96S66 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLCC1Q96S66 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLCC1Q96S66 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLCC1Q96S66 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLCC1Q96S66 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLCC1Q96S66 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLCC1Q96S66 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLCC1Q96S66 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLCC1Q96S66 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLCC1Q96S66 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLCC1Q96S66 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLCC1Q96S66 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLCC1Q96S66 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLCC1Q96S66 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLCC1Q96S66 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLCC1Q96S66 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLCC1Q96S66 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLCC1Q96S66 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLCC1Q96S66 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLCC1Q96S66 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLCC1Q96S66 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLCC1Q96S66 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLCC1Q96S66 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLCC1Q96S66 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CLCC1Q96S66 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLCC1Q96S66 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLCC1Q96S66 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CLCC1Q96S66 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLCC1Q96S66 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLCC1Q96S66 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLCC1Q96S66 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLCC1Q96S66 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLCC1Q96S66 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLCC1Q96S66 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLCC1Q96S66 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLCC1Q96S66 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLCC1Q96S66 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLCC1Q96S66 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLCC1Q96S66 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLCC1Q96S66 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLCC1Q96S66 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLCC1Q96S66 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLCC1Q96S66 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLCC1Q96S66 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLCC1Q96S66 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLCC1Q96S66 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLCC1Q96S66 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLCC1Q96S66 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLCC1Q96S66 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLCC1Q96S66 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLCC1Q96S66 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLCC1Q96S66 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms