Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC85AQ96PX6 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC85AQ96PX6 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC85AQ96PX6 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC85AQ96PX6 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC85AQ96PX6 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC85AQ96PX6 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC85AQ96PX6 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC85AQ96PX6 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC85AQ96PX6 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC85AQ96PX6 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC85AQ96PX6 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC85AQ96PX6 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC85AQ96PX6 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC85AQ96PX6 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC85AQ96PX6 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC85AQ96PX6 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC85AQ96PX6 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC85AQ96PX6 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC85AQ96PX6 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms