Protein–RNA interactions for Protein: Q96MX3

ZNF48, Zinc finger protein 48, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF48Q96MX3 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF48Q96MX3 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF48Q96MX3 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF48Q96MX3 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF48Q96MX3 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF48Q96MX3 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF48Q96MX3 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF48Q96MX3 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF48Q96MX3 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF48Q96MX3 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF48Q96MX3 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF48Q96MX3 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF48Q96MX3 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF48Q96MX3 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF48Q96MX3 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF48Q96MX3 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF48Q96MX3 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF48Q96MX3 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF48Q96MX3 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF48Q96MX3 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF48Q96MX3 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF48Q96MX3 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF48Q96MX3 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF48Q96MX3 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF48Q96MX3 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF48Q96MX3 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF48Q96MX3 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF48Q96MX3 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF48Q96MX3 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF48Q96MX3 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF48Q96MX3 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF48Q96MX3 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF48Q96MX3 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF48Q96MX3 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF48Q96MX3 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF48Q96MX3 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF48Q96MX3 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF48Q96MX3 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF48Q96MX3 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF48Q96MX3 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF48Q96MX3 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF48Q96MX3 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF48Q96MX3 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF48Q96MX3 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF48Q96MX3 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF48Q96MX3 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF48Q96MX3 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF48Q96MX3 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF48Q96MX3 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF48Q96MX3 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF48Q96MX3 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF48Q96MX3 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF48Q96MX3 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF48Q96MX3 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF48Q96MX3 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNF48Q96MX3 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNF48Q96MX3 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNF48Q96MX3 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNF48Q96MX3 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNF48Q96MX3 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNF48Q96MX3 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF48Q96MX3 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF48Q96MX3 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF48Q96MX3 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF48Q96MX3 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF48Q96MX3 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF48Q96MX3 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF48Q96MX3 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF48Q96MX3 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF48Q96MX3 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ZNF48Q96MX3 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF48Q96MX3 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF48Q96MX3 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ZNF48Q96MX3 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF48Q96MX3 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF48Q96MX3 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF48Q96MX3 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF48Q96MX3 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF48Q96MX3 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF48Q96MX3 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF48Q96MX3 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF48Q96MX3 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF48Q96MX3 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF48Q96MX3 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF48Q96MX3 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF48Q96MX3 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ZNF48Q96MX3 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF48Q96MX3 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF48Q96MX3 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF48Q96MX3 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF48Q96MX3 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF48Q96MX3 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF48Q96MX3 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF48Q96MX3 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF48Q96MX3 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF48Q96MX3 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF48Q96MX3 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF48Q96MX3 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF48Q96MX3 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF48Q96MX3 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms