Protein–RNA interactions for Protein: Q96MT7

CFAP44, Cilia- and flagella-associated protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 982 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP44Q96MT7 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP44Q96MT7 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP44Q96MT7 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP44Q96MT7 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP44Q96MT7 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP44Q96MT7 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP44Q96MT7 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP44Q96MT7 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP44Q96MT7 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP44Q96MT7 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP44Q96MT7 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP44Q96MT7 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP44Q96MT7 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP44Q96MT7 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP44Q96MT7 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP44Q96MT7 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP44Q96MT7 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP44Q96MT7 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP44Q96MT7 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP44Q96MT7 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP44Q96MT7 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP44Q96MT7 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP44Q96MT7 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP44Q96MT7 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP44Q96MT7 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP44Q96MT7 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP44Q96MT7 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP44Q96MT7 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP44Q96MT7 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP44Q96MT7 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP44Q96MT7 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP44Q96MT7 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP44Q96MT7 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP44Q96MT7 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP44Q96MT7 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP44Q96MT7 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP44Q96MT7 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP44Q96MT7 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP44Q96MT7 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CFAP44Q96MT7 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CFAP44Q96MT7 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CFAP44Q96MT7 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CFAP44Q96MT7 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CFAP44Q96MT7 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CFAP44Q96MT7 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CFAP44Q96MT7 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CFAP44Q96MT7 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CFAP44Q96MT7 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CFAP44Q96MT7 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CFAP44Q96MT7 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CFAP44Q96MT7 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CFAP44Q96MT7 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CFAP44Q96MT7 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CFAP44Q96MT7 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CFAP44Q96MT7 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CFAP44Q96MT7 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CFAP44Q96MT7 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CFAP44Q96MT7 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CFAP44Q96MT7 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CFAP44Q96MT7 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CFAP44Q96MT7 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CFAP44Q96MT7 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CFAP44Q96MT7 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CFAP44Q96MT7 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CFAP44Q96MT7 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CFAP44Q96MT7 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CFAP44Q96MT7 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFAP44Q96MT7 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFAP44Q96MT7 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFAP44Q96MT7 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFAP44Q96MT7 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFAP44Q96MT7 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFAP44Q96MT7 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFAP44Q96MT7 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CFAP44Q96MT7 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFAP44Q96MT7 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFAP44Q96MT7 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFAP44Q96MT7 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFAP44Q96MT7 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFAP44Q96MT7 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFAP44Q96MT7 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CFAP44Q96MT7 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CFAP44Q96MT7 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CFAP44Q96MT7 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CFAP44Q96MT7 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CFAP44Q96MT7 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CFAP44Q96MT7 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CFAP44Q96MT7 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CFAP44Q96MT7 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CFAP44Q96MT7 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CFAP44Q96MT7 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CFAP44Q96MT7 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CFAP44Q96MT7 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CFAP44Q96MT7 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CFAP44Q96MT7 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CFAP44Q96MT7 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CFAP44Q96MT7 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CFAP44Q96MT7 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CFAP44Q96MT7 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CFAP44Q96MT7 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms