Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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SAMD8Q96LT4 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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SAMD8Q96LT4 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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SAMD8Q96LT4 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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SAMD8Q96LT4 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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SAMD8Q96LT4 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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SAMD8Q96LT4 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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SAMD8Q96LT4 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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