Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms