Protein–RNA interactions for Protein: Q96G28

CFAP36, Cilia- and flagella-associated protein 36, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP36Q96G28 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CFAP36Q96G28 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CFAP36Q96G28 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CFAP36Q96G28 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CFAP36Q96G28 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CFAP36Q96G28 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CFAP36Q96G28 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CFAP36Q96G28 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CFAP36Q96G28 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CFAP36Q96G28 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CFAP36Q96G28 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CFAP36Q96G28 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CFAP36Q96G28 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CFAP36Q96G28 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CFAP36Q96G28 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CFAP36Q96G28 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CFAP36Q96G28 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CFAP36Q96G28 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CFAP36Q96G28 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CFAP36Q96G28 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CFAP36Q96G28 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CFAP36Q96G28 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CFAP36Q96G28 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CFAP36Q96G28 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CFAP36Q96G28 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CFAP36Q96G28 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CFAP36Q96G28 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CFAP36Q96G28 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CFAP36Q96G28 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CFAP36Q96G28 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CFAP36Q96G28 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CFAP36Q96G28 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CFAP36Q96G28 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CFAP36Q96G28 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CFAP36Q96G28 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CFAP36Q96G28 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CFAP36Q96G28 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CFAP36Q96G28 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CFAP36Q96G28 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CFAP36Q96G28 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CFAP36Q96G28 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CFAP36Q96G28 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CFAP36Q96G28 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CFAP36Q96G28 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CFAP36Q96G28 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CFAP36Q96G28 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CFAP36Q96G28 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CFAP36Q96G28 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CFAP36Q96G28 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CFAP36Q96G28 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CFAP36Q96G28 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CFAP36Q96G28 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CFAP36Q96G28 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CFAP36Q96G28 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CFAP36Q96G28 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CFAP36Q96G28 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CFAP36Q96G28 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CFAP36Q96G28 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CFAP36Q96G28 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CFAP36Q96G28 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CFAP36Q96G28 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CFAP36Q96G28 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CFAP36Q96G28 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CFAP36Q96G28 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CFAP36Q96G28 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CFAP36Q96G28 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CFAP36Q96G28 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CFAP36Q96G28 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CFAP36Q96G28 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CFAP36Q96G28 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CFAP36Q96G28 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CFAP36Q96G28 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CFAP36Q96G28 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CFAP36Q96G28 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CFAP36Q96G28 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CFAP36Q96G28 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CFAP36Q96G28 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CFAP36Q96G28 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CFAP36Q96G28 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CFAP36Q96G28 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CFAP36Q96G28 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CFAP36Q96G28 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CFAP36Q96G28 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CFAP36Q96G28 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CFAP36Q96G28 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CFAP36Q96G28 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CFAP36Q96G28 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CFAP36Q96G28 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CFAP36Q96G28 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CFAP36Q96G28 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CFAP36Q96G28 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CFAP36Q96G28 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CFAP36Q96G28 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CFAP36Q96G28 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CFAP36Q96G28 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CFAP36Q96G28 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CFAP36Q96G28 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CFAP36Q96G28 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CFAP36Q96G28 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CFAP36Q96G28 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms