Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ9

CMTM5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM5Q96DZ9 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms