Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms