Protein–RNA interactions for Protein: Q969G9

NKD1, Protein naked cuticle homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD1Q969G9 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NKD1Q969G9 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms