Protein–RNA interactions for Protein: Q92994

BRF1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, humanhuman

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Length 677 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1Q92994 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
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BRF1Q92994 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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BRF1Q92994 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
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BRF1Q92994 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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BRF1Q92994 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
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