Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
HERVK_113Q902F9 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HERVK_113Q902F9 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HERVK_113Q902F9 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HERVK_113Q902F9 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HERVK_113Q902F9 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HERVK_113Q902F9 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HERVK_113Q902F9 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HERVK_113Q902F9 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HERVK_113Q902F9 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HERVK_113Q902F9 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HERVK_113Q902F9 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HERVK_113Q902F9 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HERVK_113Q902F9 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
HERVK_113Q902F9 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
HERVK_113Q902F9 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms