Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDQ0

HAVCR2, Hepatitis A virus cellular receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAVCR2Q8TDQ0 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HAVCR2Q8TDQ0 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HAVCR2Q8TDQ0 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HAVCR2Q8TDQ0 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HAVCR2Q8TDQ0 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HAVCR2Q8TDQ0 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HAVCR2Q8TDQ0 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HAVCR2Q8TDQ0 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HAVCR2Q8TDQ0 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HAVCR2Q8TDQ0 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HAVCR2Q8TDQ0 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HAVCR2Q8TDQ0 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HAVCR2Q8TDQ0 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HAVCR2Q8TDQ0 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HAVCR2Q8TDQ0 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HAVCR2Q8TDQ0 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HAVCR2Q8TDQ0 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HAVCR2Q8TDQ0 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HAVCR2Q8TDQ0 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HAVCR2Q8TDQ0 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HAVCR2Q8TDQ0 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HAVCR2Q8TDQ0 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HAVCR2Q8TDQ0 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HAVCR2Q8TDQ0 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HAVCR2Q8TDQ0 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HAVCR2Q8TDQ0 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HAVCR2Q8TDQ0 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HAVCR2Q8TDQ0 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HAVCR2Q8TDQ0 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HAVCR2Q8TDQ0 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HAVCR2Q8TDQ0 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HAVCR2Q8TDQ0 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HAVCR2Q8TDQ0 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HAVCR2Q8TDQ0 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HAVCR2Q8TDQ0 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HAVCR2Q8TDQ0 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HAVCR2Q8TDQ0 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HAVCR2Q8TDQ0 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HAVCR2Q8TDQ0 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HAVCR2Q8TDQ0 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HAVCR2Q8TDQ0 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HAVCR2Q8TDQ0 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HAVCR2Q8TDQ0 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HAVCR2Q8TDQ0 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HAVCR2Q8TDQ0 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HAVCR2Q8TDQ0 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HAVCR2Q8TDQ0 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HAVCR2Q8TDQ0 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HAVCR2Q8TDQ0 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HAVCR2Q8TDQ0 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HAVCR2Q8TDQ0 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HAVCR2Q8TDQ0 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HAVCR2Q8TDQ0 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HAVCR2Q8TDQ0 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HAVCR2Q8TDQ0 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HAVCR2Q8TDQ0 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HAVCR2Q8TDQ0 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HAVCR2Q8TDQ0 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HAVCR2Q8TDQ0 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HAVCR2Q8TDQ0 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HAVCR2Q8TDQ0 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HAVCR2Q8TDQ0 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HAVCR2Q8TDQ0 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HAVCR2Q8TDQ0 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HAVCR2Q8TDQ0 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HAVCR2Q8TDQ0 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HAVCR2Q8TDQ0 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HAVCR2Q8TDQ0 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HAVCR2Q8TDQ0 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HAVCR2Q8TDQ0 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HAVCR2Q8TDQ0 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HAVCR2Q8TDQ0 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HAVCR2Q8TDQ0 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HAVCR2Q8TDQ0 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HAVCR2Q8TDQ0 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HAVCR2Q8TDQ0 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HAVCR2Q8TDQ0 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HAVCR2Q8TDQ0 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HAVCR2Q8TDQ0 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HAVCR2Q8TDQ0 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HAVCR2Q8TDQ0 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HAVCR2Q8TDQ0 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HAVCR2Q8TDQ0 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HAVCR2Q8TDQ0 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HAVCR2Q8TDQ0 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HAVCR2Q8TDQ0 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HAVCR2Q8TDQ0 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HAVCR2Q8TDQ0 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HAVCR2Q8TDQ0 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HAVCR2Q8TDQ0 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HAVCR2Q8TDQ0 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HAVCR2Q8TDQ0 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HAVCR2Q8TDQ0 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HAVCR2Q8TDQ0 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HAVCR2Q8TDQ0 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HAVCR2Q8TDQ0 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HAVCR2Q8TDQ0 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HAVCR2Q8TDQ0 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HAVCR2Q8TDQ0 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HAVCR2Q8TDQ0 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms