Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA58

PNLDC1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNLDC1Q8NA58 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms