Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA47

CCDC63, Coiled-coil domain-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC63Q8NA47 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms