Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4S0

CCDC82, Coiled-coil domain-containing protein 82, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82Q8N4S0 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC82Q8N4S0 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC82Q8N4S0 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC82Q8N4S0 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC82Q8N4S0 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC82Q8N4S0 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC82Q8N4S0 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC82Q8N4S0 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC82Q8N4S0 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC82Q8N4S0 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC82Q8N4S0 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC82Q8N4S0 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC82Q8N4S0 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC82Q8N4S0 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC82Q8N4S0 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC82Q8N4S0 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC82Q8N4S0 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC82Q8N4S0 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC82Q8N4S0 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC82Q8N4S0 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC82Q8N4S0 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC82Q8N4S0 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC82Q8N4S0 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC82Q8N4S0 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC82Q8N4S0 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC82Q8N4S0 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC82Q8N4S0 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC82Q8N4S0 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC82Q8N4S0 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC82Q8N4S0 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC82Q8N4S0 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC82Q8N4S0 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC82Q8N4S0 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC82Q8N4S0 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC82Q8N4S0 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC82Q8N4S0 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC82Q8N4S0 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC82Q8N4S0 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC82Q8N4S0 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC82Q8N4S0 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC82Q8N4S0 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC82Q8N4S0 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC82Q8N4S0 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC82Q8N4S0 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC82Q8N4S0 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC82Q8N4S0 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC82Q8N4S0 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC82Q8N4S0 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC82Q8N4S0 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC82Q8N4S0 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC82Q8N4S0 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC82Q8N4S0 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC82Q8N4S0 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC82Q8N4S0 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC82Q8N4S0 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC82Q8N4S0 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC82Q8N4S0 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC82Q8N4S0 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC82Q8N4S0 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC82Q8N4S0 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC82Q8N4S0 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC82Q8N4S0 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC82Q8N4S0 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC82Q8N4S0 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC82Q8N4S0 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC82Q8N4S0 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC82Q8N4S0 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC82Q8N4S0 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC82Q8N4S0 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC82Q8N4S0 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC82Q8N4S0 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC82Q8N4S0 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC82Q8N4S0 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC82Q8N4S0 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC82Q8N4S0 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC82Q8N4S0 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC82Q8N4S0 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC82Q8N4S0 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC82Q8N4S0 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC82Q8N4S0 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC82Q8N4S0 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC82Q8N4S0 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC82Q8N4S0 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC82Q8N4S0 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC82Q8N4S0 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC82Q8N4S0 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC82Q8N4S0 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC82Q8N4S0 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC82Q8N4S0 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC82Q8N4S0 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC82Q8N4S0 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC82Q8N4S0 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC82Q8N4S0 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC82Q8N4S0 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC82Q8N4S0 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC82Q8N4S0 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC82Q8N4S0 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC82Q8N4S0 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC82Q8N4S0 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC82Q8N4S0 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms