Protein–RNA interactions for Protein: Q7L5N1

COPS6, COP9 signalosome complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS6Q7L5N1 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COPS6Q7L5N1 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COPS6Q7L5N1 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COPS6Q7L5N1 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COPS6Q7L5N1 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COPS6Q7L5N1 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COPS6Q7L5N1 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COPS6Q7L5N1 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COPS6Q7L5N1 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COPS6Q7L5N1 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COPS6Q7L5N1 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COPS6Q7L5N1 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COPS6Q7L5N1 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COPS6Q7L5N1 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
COPS6Q7L5N1 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COPS6Q7L5N1 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
COPS6Q7L5N1 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COPS6Q7L5N1 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COPS6Q7L5N1 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COPS6Q7L5N1 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COPS6Q7L5N1 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COPS6Q7L5N1 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COPS6Q7L5N1 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COPS6Q7L5N1 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COPS6Q7L5N1 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COPS6Q7L5N1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COPS6Q7L5N1 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COPS6Q7L5N1 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COPS6Q7L5N1 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COPS6Q7L5N1 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COPS6Q7L5N1 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COPS6Q7L5N1 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COPS6Q7L5N1 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COPS6Q7L5N1 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COPS6Q7L5N1 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COPS6Q7L5N1 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COPS6Q7L5N1 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COPS6Q7L5N1 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COPS6Q7L5N1 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
COPS6Q7L5N1 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COPS6Q7L5N1 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COPS6Q7L5N1 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COPS6Q7L5N1 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
COPS6Q7L5N1 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COPS6Q7L5N1 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
COPS6Q7L5N1 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COPS6Q7L5N1 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COPS6Q7L5N1 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COPS6Q7L5N1 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COPS6Q7L5N1 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COPS6Q7L5N1 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COPS6Q7L5N1 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COPS6Q7L5N1 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COPS6Q7L5N1 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COPS6Q7L5N1 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COPS6Q7L5N1 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COPS6Q7L5N1 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COPS6Q7L5N1 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COPS6Q7L5N1 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COPS6Q7L5N1 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COPS6Q7L5N1 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COPS6Q7L5N1 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COPS6Q7L5N1 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COPS6Q7L5N1 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COPS6Q7L5N1 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COPS6Q7L5N1 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COPS6Q7L5N1 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COPS6Q7L5N1 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COPS6Q7L5N1 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COPS6Q7L5N1 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COPS6Q7L5N1 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COPS6Q7L5N1 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COPS6Q7L5N1 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COPS6Q7L5N1 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COPS6Q7L5N1 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
COPS6Q7L5N1 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COPS6Q7L5N1 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COPS6Q7L5N1 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COPS6Q7L5N1 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COPS6Q7L5N1 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COPS6Q7L5N1 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COPS6Q7L5N1 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COPS6Q7L5N1 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COPS6Q7L5N1 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COPS6Q7L5N1 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COPS6Q7L5N1 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COPS6Q7L5N1 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COPS6Q7L5N1 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COPS6Q7L5N1 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COPS6Q7L5N1 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COPS6Q7L5N1 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COPS6Q7L5N1 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COPS6Q7L5N1 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COPS6Q7L5N1 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COPS6Q7L5N1 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COPS6Q7L5N1 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COPS6Q7L5N1 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COPS6Q7L5N1 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COPS6Q7L5N1 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COPS6Q7L5N1 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms