Protein–RNA interactions for Protein: Q7L5L3

GDPD3, Lysophospholipase D GDPD3, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD3Q7L5L3 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GDPD3Q7L5L3 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GDPD3Q7L5L3 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GDPD3Q7L5L3 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GDPD3Q7L5L3 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GDPD3Q7L5L3 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GDPD3Q7L5L3 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GDPD3Q7L5L3 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GDPD3Q7L5L3 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GDPD3Q7L5L3 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GDPD3Q7L5L3 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GDPD3Q7L5L3 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GDPD3Q7L5L3 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GDPD3Q7L5L3 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GDPD3Q7L5L3 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GDPD3Q7L5L3 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GDPD3Q7L5L3 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GDPD3Q7L5L3 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GDPD3Q7L5L3 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GDPD3Q7L5L3 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GDPD3Q7L5L3 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GDPD3Q7L5L3 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GDPD3Q7L5L3 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GDPD3Q7L5L3 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GDPD3Q7L5L3 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GDPD3Q7L5L3 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GDPD3Q7L5L3 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GDPD3Q7L5L3 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GDPD3Q7L5L3 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GDPD3Q7L5L3 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GDPD3Q7L5L3 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GDPD3Q7L5L3 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GDPD3Q7L5L3 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GDPD3Q7L5L3 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GDPD3Q7L5L3 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GDPD3Q7L5L3 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GDPD3Q7L5L3 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GDPD3Q7L5L3 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GDPD3Q7L5L3 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GDPD3Q7L5L3 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms