Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RUFY3Q7L099 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RUFY3Q7L099 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RUFY3Q7L099 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RUFY3Q7L099 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RUFY3Q7L099 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RUFY3Q7L099 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RUFY3Q7L099 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RUFY3Q7L099 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RUFY3Q7L099 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RUFY3Q7L099 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RUFY3Q7L099 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RUFY3Q7L099 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RUFY3Q7L099 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RUFY3Q7L099 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RUFY3Q7L099 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RUFY3Q7L099 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RUFY3Q7L099 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RUFY3Q7L099 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RUFY3Q7L099 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RUFY3Q7L099 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RUFY3Q7L099 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RUFY3Q7L099 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RUFY3Q7L099 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RUFY3Q7L099 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RUFY3Q7L099 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RUFY3Q7L099 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RUFY3Q7L099 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RUFY3Q7L099 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RUFY3Q7L099 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RUFY3Q7L099 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RUFY3Q7L099 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RUFY3Q7L099 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUFY3Q7L099 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUFY3Q7L099 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUFY3Q7L099 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUFY3Q7L099 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUFY3Q7L099 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUFY3Q7L099 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUFY3Q7L099 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUFY3Q7L099 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RUFY3Q7L099 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUFY3Q7L099 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUFY3Q7L099 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUFY3Q7L099 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUFY3Q7L099 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUFY3Q7L099 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUFY3Q7L099 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUFY3Q7L099 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUFY3Q7L099 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUFY3Q7L099 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUFY3Q7L099 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUFY3Q7L099 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUFY3Q7L099 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RUFY3Q7L099 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUFY3Q7L099 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUFY3Q7L099 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUFY3Q7L099 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUFY3Q7L099 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUFY3Q7L099 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUFY3Q7L099 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUFY3Q7L099 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RUFY3Q7L099 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUFY3Q7L099 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RUFY3Q7L099 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUFY3Q7L099 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUFY3Q7L099 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUFY3Q7L099 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUFY3Q7L099 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUFY3Q7L099 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUFY3Q7L099 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUFY3Q7L099 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUFY3Q7L099 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUFY3Q7L099 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RUFY3Q7L099 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RUFY3Q7L099 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RUFY3Q7L099 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RUFY3Q7L099 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RUFY3Q7L099 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RUFY3Q7L099 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RUFY3Q7L099 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RUFY3Q7L099 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RUFY3Q7L099 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RUFY3Q7L099 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RUFY3Q7L099 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RUFY3Q7L099 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RUFY3Q7L099 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RUFY3Q7L099 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RUFY3Q7L099 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RUFY3Q7L099 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RUFY3Q7L099 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RUFY3Q7L099 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RUFY3Q7L099 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RUFY3Q7L099 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
RUFY3Q7L099 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
RUFY3Q7L099 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
RUFY3Q7L099 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
RUFY3Q7L099 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RUFY3Q7L099 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RUFY3Q7L099 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms