Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
HECW1Q76N89 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
HECW1Q76N89 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC28.76■■■□□ 2.2
HECW1Q76N89 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC28.76■■■□□ 2.2
HECW1Q76N89 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.2
HECW1Q76N89 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
HECW1Q76N89 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
HECW1Q76N89 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
HECW1Q76N89 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
HECW1Q76N89 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
HECW1Q76N89 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
HECW1Q76N89 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
HECW1Q76N89 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
HECW1Q76N89 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
HECW1Q76N89 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
HECW1Q76N89 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
HECW1Q76N89 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
HECW1Q76N89 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
HECW1Q76N89 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
HECW1Q76N89 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HECW1Q76N89 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HECW1Q76N89 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HECW1Q76N89 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HECW1Q76N89 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HECW1Q76N89 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
HECW1Q76N89 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HECW1Q76N89 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HECW1Q76N89 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HECW1Q76N89 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HECW1Q76N89 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
HECW1Q76N89 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HECW1Q76N89 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
HECW1Q76N89 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HECW1Q76N89 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HECW1Q76N89 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HECW1Q76N89 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HECW1Q76N89 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HECW1Q76N89 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HECW1Q76N89 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
HECW1Q76N89 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
HECW1Q76N89 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
HECW1Q76N89 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
HECW1Q76N89 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
HECW1Q76N89 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
HECW1Q76N89 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
HECW1Q76N89 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HECW1Q76N89 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HECW1Q76N89 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HECW1Q76N89 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HECW1Q76N89 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HECW1Q76N89 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HECW1Q76N89 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
HECW1Q76N89 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
HECW1Q76N89 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
HECW1Q76N89 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
HECW1Q76N89 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
HECW1Q76N89 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
HECW1Q76N89 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
HECW1Q76N89 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
HECW1Q76N89 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
HECW1Q76N89 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
HECW1Q76N89 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
HECW1Q76N89 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
HECW1Q76N89 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
HECW1Q76N89 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
HECW1Q76N89 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
HECW1Q76N89 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
HECW1Q76N89 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
HECW1Q76N89 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
HECW1Q76N89 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
HECW1Q76N89 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
HECW1Q76N89 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
HECW1Q76N89 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
HECW1Q76N89 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
HECW1Q76N89 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
HECW1Q76N89 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
HECW1Q76N89 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
HECW1Q76N89 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
HECW1Q76N89 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
HECW1Q76N89 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
HECW1Q76N89 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
HECW1Q76N89 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
HECW1Q76N89 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HECW1Q76N89 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
HECW1Q76N89 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HECW1Q76N89 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HECW1Q76N89 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
HECW1Q76N89 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HECW1Q76N89 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
HECW1Q76N89 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HECW1Q76N89 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
HECW1Q76N89 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HECW1Q76N89 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HECW1Q76N89 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
HECW1Q76N89 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HECW1Q76N89 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HECW1Q76N89 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
HECW1Q76N89 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
HECW1Q76N89 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
HECW1Q76N89 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms