Protein–RNA interactions for Protein: Q71RS6

SLC24A5, Sodium/potassium/calcium exchanger 5, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC24A5Q71RS6 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC24A5Q71RS6 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC24A5Q71RS6 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC24A5Q71RS6 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC24A5Q71RS6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC24A5Q71RS6 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC24A5Q71RS6 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC24A5Q71RS6 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC24A5Q71RS6 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC24A5Q71RS6 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC24A5Q71RS6 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC24A5Q71RS6 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC24A5Q71RS6 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC24A5Q71RS6 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC24A5Q71RS6 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC24A5Q71RS6 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC24A5Q71RS6 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC24A5Q71RS6 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC24A5Q71RS6 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC24A5Q71RS6 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC24A5Q71RS6 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC24A5Q71RS6 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC24A5Q71RS6 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC24A5Q71RS6 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC24A5Q71RS6 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC24A5Q71RS6 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC24A5Q71RS6 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC24A5Q71RS6 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC24A5Q71RS6 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC24A5Q71RS6 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC24A5Q71RS6 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC24A5Q71RS6 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC24A5Q71RS6 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC24A5Q71RS6 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC24A5Q71RS6 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC24A5Q71RS6 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC24A5Q71RS6 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC24A5Q71RS6 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC24A5Q71RS6 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
SLC24A5Q71RS6 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.79
SLC24A5Q71RS6 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC24A5Q71RS6 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC24A5Q71RS6 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC24A5Q71RS6 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC24A5Q71RS6 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC24A5Q71RS6 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC24A5Q71RS6 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC24A5Q71RS6 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC24A5Q71RS6 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC24A5Q71RS6 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC24A5Q71RS6 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC24A5Q71RS6 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC24A5Q71RS6 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC24A5Q71RS6 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC24A5Q71RS6 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC24A5Q71RS6 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC24A5Q71RS6 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC24A5Q71RS6 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC24A5Q71RS6 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC24A5Q71RS6 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC24A5Q71RS6 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC24A5Q71RS6 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC24A5Q71RS6 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC24A5Q71RS6 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC24A5Q71RS6 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC24A5Q71RS6 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC24A5Q71RS6 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC24A5Q71RS6 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC24A5Q71RS6 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC24A5Q71RS6 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC24A5Q71RS6 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC24A5Q71RS6 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC24A5Q71RS6 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC24A5Q71RS6 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC24A5Q71RS6 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC24A5Q71RS6 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC24A5Q71RS6 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC24A5Q71RS6 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC24A5Q71RS6 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC24A5Q71RS6 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC24A5Q71RS6 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC24A5Q71RS6 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC24A5Q71RS6 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC24A5Q71RS6 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC24A5Q71RS6 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC24A5Q71RS6 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC24A5Q71RS6 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC24A5Q71RS6 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC24A5Q71RS6 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC24A5Q71RS6 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC24A5Q71RS6 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC24A5Q71RS6 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC24A5Q71RS6 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC24A5Q71RS6 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC24A5Q71RS6 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC24A5Q71RS6 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC24A5Q71RS6 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC24A5Q71RS6 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC24A5Q71RS6 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC24A5Q71RS6 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms