Protein–RNA interactions for Protein: Q71RG4

TMUB2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB2Q71RG4 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms