Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C1

SLC25A47, Solute carrier family 25 member 47, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A47Q6Q0C1 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC25A47Q6Q0C1 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC25A47Q6Q0C1 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC25A47Q6Q0C1 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC25A47Q6Q0C1 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC25A47Q6Q0C1 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC25A47Q6Q0C1 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC25A47Q6Q0C1 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC25A47Q6Q0C1 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC25A47Q6Q0C1 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC25A47Q6Q0C1 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC25A47Q6Q0C1 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC25A47Q6Q0C1 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC25A47Q6Q0C1 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC25A47Q6Q0C1 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC25A47Q6Q0C1 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC25A47Q6Q0C1 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC25A47Q6Q0C1 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC25A47Q6Q0C1 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC25A47Q6Q0C1 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC25A47Q6Q0C1 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC25A47Q6Q0C1 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC25A47Q6Q0C1 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC25A47Q6Q0C1 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC25A47Q6Q0C1 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC25A47Q6Q0C1 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC25A47Q6Q0C1 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC25A47Q6Q0C1 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC25A47Q6Q0C1 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC25A47Q6Q0C1 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC25A47Q6Q0C1 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC25A47Q6Q0C1 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC25A47Q6Q0C1 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC25A47Q6Q0C1 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC25A47Q6Q0C1 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC25A47Q6Q0C1 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC25A47Q6Q0C1 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC25A47Q6Q0C1 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC25A47Q6Q0C1 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC25A47Q6Q0C1 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC25A47Q6Q0C1 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC25A47Q6Q0C1 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC25A47Q6Q0C1 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC25A47Q6Q0C1 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC25A47Q6Q0C1 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC25A47Q6Q0C1 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC25A47Q6Q0C1 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC25A47Q6Q0C1 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC25A47Q6Q0C1 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC25A47Q6Q0C1 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC25A47Q6Q0C1 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC25A47Q6Q0C1 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC25A47Q6Q0C1 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC25A47Q6Q0C1 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC25A47Q6Q0C1 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC25A47Q6Q0C1 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC25A47Q6Q0C1 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC25A47Q6Q0C1 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC25A47Q6Q0C1 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC25A47Q6Q0C1 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC25A47Q6Q0C1 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC25A47Q6Q0C1 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC25A47Q6Q0C1 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC25A47Q6Q0C1 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC25A47Q6Q0C1 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC25A47Q6Q0C1 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC25A47Q6Q0C1 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC25A47Q6Q0C1 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC25A47Q6Q0C1 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC25A47Q6Q0C1 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC25A47Q6Q0C1 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC25A47Q6Q0C1 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC25A47Q6Q0C1 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC25A47Q6Q0C1 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC25A47Q6Q0C1 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC25A47Q6Q0C1 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC25A47Q6Q0C1 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC25A47Q6Q0C1 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC25A47Q6Q0C1 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC25A47Q6Q0C1 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC25A47Q6Q0C1 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC25A47Q6Q0C1 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC25A47Q6Q0C1 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC25A47Q6Q0C1 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC25A47Q6Q0C1 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC25A47Q6Q0C1 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC25A47Q6Q0C1 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC25A47Q6Q0C1 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC25A47Q6Q0C1 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC25A47Q6Q0C1 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC25A47Q6Q0C1 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC25A47Q6Q0C1 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC25A47Q6Q0C1 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC25A47Q6Q0C1 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC25A47Q6Q0C1 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC25A47Q6Q0C1 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC25A47Q6Q0C1 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC25A47Q6Q0C1 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC25A47Q6Q0C1 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC25A47Q6Q0C1 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms