Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXP0

EFCAB12, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB12Q6NXP0 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms