Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWL7

PRAMEF14, PRAME family member 14, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF14Q5SWL7 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF14Q5SWL7 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF14Q5SWL7 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF14Q5SWL7 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF14Q5SWL7 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF14Q5SWL7 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF14Q5SWL7 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF14Q5SWL7 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF14Q5SWL7 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF14Q5SWL7 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF14Q5SWL7 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF14Q5SWL7 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF14Q5SWL7 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF14Q5SWL7 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF14Q5SWL7 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF14Q5SWL7 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF14Q5SWL7 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF14Q5SWL7 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF14Q5SWL7 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF14Q5SWL7 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF14Q5SWL7 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF14Q5SWL7 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF14Q5SWL7 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF14Q5SWL7 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF14Q5SWL7 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF14Q5SWL7 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF14Q5SWL7 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF14Q5SWL7 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF14Q5SWL7 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF14Q5SWL7 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF14Q5SWL7 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF14Q5SWL7 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF14Q5SWL7 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF14Q5SWL7 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF14Q5SWL7 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF14Q5SWL7 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF14Q5SWL7 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF14Q5SWL7 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF14Q5SWL7 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF14Q5SWL7 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF14Q5SWL7 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF14Q5SWL7 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF14Q5SWL7 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF14Q5SWL7 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF14Q5SWL7 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF14Q5SWL7 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF14Q5SWL7 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF14Q5SWL7 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF14Q5SWL7 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF14Q5SWL7 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF14Q5SWL7 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF14Q5SWL7 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF14Q5SWL7 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF14Q5SWL7 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF14Q5SWL7 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF14Q5SWL7 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF14Q5SWL7 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF14Q5SWL7 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF14Q5SWL7 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF14Q5SWL7 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF14Q5SWL7 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF14Q5SWL7 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF14Q5SWL7 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF14Q5SWL7 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF14Q5SWL7 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF14Q5SWL7 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF14Q5SWL7 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF14Q5SWL7 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF14Q5SWL7 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF14Q5SWL7 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF14Q5SWL7 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF14Q5SWL7 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF14Q5SWL7 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF14Q5SWL7 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF14Q5SWL7 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF14Q5SWL7 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF14Q5SWL7 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF14Q5SWL7 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF14Q5SWL7 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF14Q5SWL7 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF14Q5SWL7 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF14Q5SWL7 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF14Q5SWL7 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF14Q5SWL7 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF14Q5SWL7 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF14Q5SWL7 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF14Q5SWL7 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRAMEF14Q5SWL7 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PRAMEF14Q5SWL7 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRAMEF14Q5SWL7 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRAMEF14Q5SWL7 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRAMEF14Q5SWL7 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRAMEF14Q5SWL7 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRAMEF14Q5SWL7 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRAMEF14Q5SWL7 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRAMEF14Q5SWL7 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRAMEF14Q5SWL7 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRAMEF14Q5SWL7 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRAMEF14Q5SWL7 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRAMEF14Q5SWL7 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms