Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms