Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TWISTNBQ3B726 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TWISTNBQ3B726 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TWISTNBQ3B726 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TWISTNBQ3B726 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TWISTNBQ3B726 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TWISTNBQ3B726 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TWISTNBQ3B726 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TWISTNBQ3B726 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TWISTNBQ3B726 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TWISTNBQ3B726 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TWISTNBQ3B726 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TWISTNBQ3B726 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TWISTNBQ3B726 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TWISTNBQ3B726 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TWISTNBQ3B726 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TWISTNBQ3B726 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TWISTNBQ3B726 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TWISTNBQ3B726 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TWISTNBQ3B726 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TWISTNBQ3B726 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TWISTNBQ3B726 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TWISTNBQ3B726 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TWISTNBQ3B726 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TWISTNBQ3B726 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TWISTNBQ3B726 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TWISTNBQ3B726 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TWISTNBQ3B726 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TWISTNBQ3B726 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TWISTNBQ3B726 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TWISTNBQ3B726 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TWISTNBQ3B726 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TWISTNBQ3B726 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TWISTNBQ3B726 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TWISTNBQ3B726 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TWISTNBQ3B726 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TWISTNBQ3B726 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TWISTNBQ3B726 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TWISTNBQ3B726 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TWISTNBQ3B726 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TWISTNBQ3B726 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TWISTNBQ3B726 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TWISTNBQ3B726 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TWISTNBQ3B726 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TWISTNBQ3B726 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TWISTNBQ3B726 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TWISTNBQ3B726 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TWISTNBQ3B726 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TWISTNBQ3B726 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TWISTNBQ3B726 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TWISTNBQ3B726 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TWISTNBQ3B726 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TWISTNBQ3B726 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TWISTNBQ3B726 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TWISTNBQ3B726 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TWISTNBQ3B726 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TWISTNBQ3B726 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TWISTNBQ3B726 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TWISTNBQ3B726 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TWISTNBQ3B726 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TWISTNBQ3B726 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TWISTNBQ3B726 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TWISTNBQ3B726 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TWISTNBQ3B726 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TWISTNBQ3B726 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TWISTNBQ3B726 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TWISTNBQ3B726 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TWISTNBQ3B726 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TWISTNBQ3B726 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TWISTNBQ3B726 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TWISTNBQ3B726 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TWISTNBQ3B726 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TWISTNBQ3B726 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TWISTNBQ3B726 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TWISTNBQ3B726 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TWISTNBQ3B726 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TWISTNBQ3B726 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TWISTNBQ3B726 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TWISTNBQ3B726 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TWISTNBQ3B726 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TWISTNBQ3B726 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TWISTNBQ3B726 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TWISTNBQ3B726 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TWISTNBQ3B726 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TWISTNBQ3B726 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TWISTNBQ3B726 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TWISTNBQ3B726 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TWISTNBQ3B726 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TWISTNBQ3B726 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TWISTNBQ3B726 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TWISTNBQ3B726 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TWISTNBQ3B726 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TWISTNBQ3B726 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TWISTNBQ3B726 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TWISTNBQ3B726 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TWISTNBQ3B726 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TWISTNBQ3B726 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TWISTNBQ3B726 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TWISTNBQ3B726 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TWISTNBQ3B726 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms