Protein–RNA interactions for Protein: Q2WEN9

CEACAM16, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 16, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM16Q2WEN9 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEACAM16Q2WEN9 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CEACAM16Q2WEN9 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEACAM16Q2WEN9 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEACAM16Q2WEN9 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CEACAM16Q2WEN9 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CEACAM16Q2WEN9 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEACAM16Q2WEN9 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEACAM16Q2WEN9 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEACAM16Q2WEN9 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEACAM16Q2WEN9 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEACAM16Q2WEN9 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEACAM16Q2WEN9 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEACAM16Q2WEN9 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEACAM16Q2WEN9 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEACAM16Q2WEN9 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEACAM16Q2WEN9 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEACAM16Q2WEN9 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CEACAM16Q2WEN9 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEACAM16Q2WEN9 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEACAM16Q2WEN9 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEACAM16Q2WEN9 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEACAM16Q2WEN9 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEACAM16Q2WEN9 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEACAM16Q2WEN9 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEACAM16Q2WEN9 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEACAM16Q2WEN9 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEACAM16Q2WEN9 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEACAM16Q2WEN9 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEACAM16Q2WEN9 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEACAM16Q2WEN9 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEACAM16Q2WEN9 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEACAM16Q2WEN9 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEACAM16Q2WEN9 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEACAM16Q2WEN9 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEACAM16Q2WEN9 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CEACAM16Q2WEN9 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEACAM16Q2WEN9 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEACAM16Q2WEN9 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEACAM16Q2WEN9 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEACAM16Q2WEN9 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEACAM16Q2WEN9 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEACAM16Q2WEN9 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEACAM16Q2WEN9 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEACAM16Q2WEN9 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEACAM16Q2WEN9 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEACAM16Q2WEN9 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEACAM16Q2WEN9 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CEACAM16Q2WEN9 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CEACAM16Q2WEN9 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEACAM16Q2WEN9 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEACAM16Q2WEN9 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEACAM16Q2WEN9 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEACAM16Q2WEN9 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CEACAM16Q2WEN9 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEACAM16Q2WEN9 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEACAM16Q2WEN9 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEACAM16Q2WEN9 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEACAM16Q2WEN9 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEACAM16Q2WEN9 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEACAM16Q2WEN9 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEACAM16Q2WEN9 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEACAM16Q2WEN9 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEACAM16Q2WEN9 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEACAM16Q2WEN9 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEACAM16Q2WEN9 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEACAM16Q2WEN9 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEACAM16Q2WEN9 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CEACAM16Q2WEN9 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEACAM16Q2WEN9 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CEACAM16Q2WEN9 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEACAM16Q2WEN9 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEACAM16Q2WEN9 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CEACAM16Q2WEN9 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEACAM16Q2WEN9 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEACAM16Q2WEN9 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEACAM16Q2WEN9 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEACAM16Q2WEN9 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEACAM16Q2WEN9 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEACAM16Q2WEN9 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEACAM16Q2WEN9 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEACAM16Q2WEN9 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEACAM16Q2WEN9 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEACAM16Q2WEN9 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEACAM16Q2WEN9 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CEACAM16Q2WEN9 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CEACAM16Q2WEN9 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEACAM16Q2WEN9 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEACAM16Q2WEN9 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEACAM16Q2WEN9 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEACAM16Q2WEN9 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEACAM16Q2WEN9 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEACAM16Q2WEN9 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEACAM16Q2WEN9 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEACAM16Q2WEN9 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CEACAM16Q2WEN9 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEACAM16Q2WEN9 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEACAM16Q2WEN9 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEACAM16Q2WEN9 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEACAM16Q2WEN9 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms