Protein–RNA interactions for Protein: Q2V2M9

FHOD3, FH1/FH2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHOD3Q2V2M9 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
FHOD3Q2V2M9 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
FHOD3Q2V2M9 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
FHOD3Q2V2M9 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
FHOD3Q2V2M9 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
FHOD3Q2V2M9 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
FHOD3Q2V2M9 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
FHOD3Q2V2M9 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
FHOD3Q2V2M9 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
FHOD3Q2V2M9 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
FHOD3Q2V2M9 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
FHOD3Q2V2M9 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
FHOD3Q2V2M9 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
FHOD3Q2V2M9 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
FHOD3Q2V2M9 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
FHOD3Q2V2M9 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
FHOD3Q2V2M9 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
FHOD3Q2V2M9 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
FHOD3Q2V2M9 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
FHOD3Q2V2M9 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
FHOD3Q2V2M9 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
FHOD3Q2V2M9 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
FHOD3Q2V2M9 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
FHOD3Q2V2M9 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
FHOD3Q2V2M9 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
FHOD3Q2V2M9 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
FHOD3Q2V2M9 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
FHOD3Q2V2M9 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
FHOD3Q2V2M9 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
FHOD3Q2V2M9 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
FHOD3Q2V2M9 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
FHOD3Q2V2M9 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
FHOD3Q2V2M9 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
FHOD3Q2V2M9 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
FHOD3Q2V2M9 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
FHOD3Q2V2M9 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
FHOD3Q2V2M9 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
FHOD3Q2V2M9 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
FHOD3Q2V2M9 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
FHOD3Q2V2M9 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
FHOD3Q2V2M9 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
FHOD3Q2V2M9 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
FHOD3Q2V2M9 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
FHOD3Q2V2M9 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
FHOD3Q2V2M9 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
FHOD3Q2V2M9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
FHOD3Q2V2M9 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
FHOD3Q2V2M9 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
FHOD3Q2V2M9 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
FHOD3Q2V2M9 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
FHOD3Q2V2M9 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
FHOD3Q2V2M9 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
FHOD3Q2V2M9 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
FHOD3Q2V2M9 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
FHOD3Q2V2M9 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
FHOD3Q2V2M9 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
FHOD3Q2V2M9 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
FHOD3Q2V2M9 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
FHOD3Q2V2M9 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
FHOD3Q2V2M9 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
FHOD3Q2V2M9 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
FHOD3Q2V2M9 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
FHOD3Q2V2M9 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
FHOD3Q2V2M9 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
FHOD3Q2V2M9 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
FHOD3Q2V2M9 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
FHOD3Q2V2M9 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
FHOD3Q2V2M9 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
FHOD3Q2V2M9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
FHOD3Q2V2M9 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
FHOD3Q2V2M9 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
FHOD3Q2V2M9 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
FHOD3Q2V2M9 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
FHOD3Q2V2M9 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
FHOD3Q2V2M9 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
FHOD3Q2V2M9 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
FHOD3Q2V2M9 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
FHOD3Q2V2M9 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
FHOD3Q2V2M9 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
FHOD3Q2V2M9 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
FHOD3Q2V2M9 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
FHOD3Q2V2M9 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
FHOD3Q2V2M9 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
FHOD3Q2V2M9 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
FHOD3Q2V2M9 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
FHOD3Q2V2M9 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
FHOD3Q2V2M9 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
FHOD3Q2V2M9 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
FHOD3Q2V2M9 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
FHOD3Q2V2M9 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
FHOD3Q2V2M9 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
FHOD3Q2V2M9 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
FHOD3Q2V2M9 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
FHOD3Q2V2M9 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
FHOD3Q2V2M9 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
FHOD3Q2V2M9 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
FHOD3Q2V2M9 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
FHOD3Q2V2M9 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
FHOD3Q2V2M9 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
FHOD3Q2V2M9 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms