Protein–RNA interactions for Protein: Q2T9J0

TYSND1, Peroxisomal leader peptide-processing protease, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYSND1Q2T9J0 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms