Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
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