Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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RTL8BQ17RB0 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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RTL8BQ17RB0 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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