Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTF1Q16619 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms